Ngồi khóc trên cây là một truyện dài của Nguyễn Nhật Ánh, được ông viết xong vào ngày 7 tháng 4 năm 2013.[19] Tác phẩm viết ở ngôi kể thứ nhất, chia thành ba chương dài, mỗi chương được đề từ bằng những vần thơ do chính nhà văn sáng tác. Như phần lớn các tác phẩm trước đây, truyện tiếp tục là cầu nối dẫn vào thế giới tuổi thơ đầy màu sắc mà nhà văn Nguyễn Nhật Ánh muốn truyền tải đến độc giả. Trong truyện có hình ảnh một con ngỗng là vật nuôi của Rùa, và cảnh tượng ngỗng rượt và mổ người liên đới trực tiếp đến một kỷ niệm thời thơ ấu của nhà văn.[21] Nhà văn chia sẻ rằng so với các sáng tác trước, Ngồi khóc trên cây ít đối thoại hơn mà tập trung vào khảo sát tâm trạng và miêu tả sâu vào tâm trạng nhân vật nhiều hơn.[22] Cũng theo Nguyễn Nhật Ánh, chưa có nhân vật nào trong các tác phẩm của ông rơi vào nghịch cảnh éo le như nhân vật Rùa, và cũng chưa bao giờ ông đi sâu miêu tả nội tâm nhân vật như thế.[23] Bằng cách này, ông muốn thử xem các nhân vật sẽ hành động như thế nào khi phát hiện ra người mình thích có quan hệ huyết thống, cũng như nhiều tình huống éo le khác nữa, khiến cho câu chuyện có phần buồn.[24]

Nhân dịp ra mắt Ngồi khóc trên cây, Nhà xuất bản Trẻ đã tổ chức hai cuộc thi viết "Nhìn hình minh họa đoán nội dung truyện" và "Nguyễn Nhật Ánh và tôi".[1] Cuốn sách, được giới thiệu như một thế giới kỳ diệu và xinh đẹp, một tình yêu đầu đời trong trẻo, với những cảm xúc nhớ thương, đợi chờ khắc khoải…, phát hành ngày 27 tháng 6 năm 2013 dưới dạng hai ấn bản là bản thường bìa mềm và bản đặc biệt bìa cứng. Cả hai ấn bản có khoảng 30 tranh minh họa và thẻ đánh dấu trang do họa sĩ Đỗ Hoàng Tường thực hiện, riêng bản đặc biệt có thêm bốn tranh màu làm phụ bản.[25] Nhà văn Nguyễn Nhật Ánh đã tham dự ba buổi ký tặng độc giả nhân dịp ra mắt tác phẩm vào các ngày 27, 30 tháng 6 và 7 tháng 7 tại Thành phố Hồ Chí Minh và Hà Nội.[26]